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新疆冷泉沉积物葡萄糖利用细菌群落多样性的稳定同位素标记分析
新疆冷泉沉积物葡萄糖利用细菌群落多样性的稳定同位素标记分析
作者:
娄恺
张志东
曾军
楚敏
王芸
原文服务方:
生态学报
冷泉
稳定同位素
细菌多样性
摘要:
新疆沙湾冷泉低盐且不含硫化物,为了解其沉积物细菌群落的碳源利用,以13C稳定同位素标记的葡萄糖作为底物培养沉积物中的细菌,通过提取和分离带有13C标记的总DNA,结合16S rDNA-PCR克隆文库法以及限制性片段长度多态性方法,对冷泉沉积物中葡萄糖利用细菌群落多样性进行分析.随机挑取417个阳性克隆,HaeⅢ酶切分型,共获得27个OTUs.经测序、序列同源性对比和系统发育学分析,归为细菌域中的9个门,即厚壁菌门(Firmicutes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)、放线菌门(Actinobacteria)、变形杆菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、浮霉菌门(Planctomycetes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria),其中,厚壁菌门和变形杆菌门为优势类群,分别占克隆文库的28.3%和38.6%.与前期研究比较,以葡萄糖为碳源的细菌OTUs仅占总菌群的31%,表明该环境中可能存在其它碳源利用方式的细菌群落.
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文献信息
篇名
新疆冷泉沉积物葡萄糖利用细菌群落多样性的稳定同位素标记分析
来源期刊
生态学报
学科
关键词
冷泉
稳定同位素
细菌多样性
年,卷(期)
2012,(14)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
4413-4420
页数
分类号
Q513.3
字数
语种
中文
DOI
10.5846/stxb201107051003
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
娄恺
新疆农业科学院微生物应用研究所
35
239
9.0
13.0
2
曾军
新疆农业科学院微生物应用研究所
13
65
6.0
7.0
3
张志东
新疆农业科学院微生物应用研究所
34
164
6.0
11.0
4
楚敏
新疆农业科学院微生物应用研究所
16
47
4.0
5.0
5
王芸
新疆农业科学院微生物应用研究所
3
9
1.0
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研究主题发展历程
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冷泉
稳定同位素
细菌多样性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生态学报
主办单位:
中国生态学学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1000-0933
CN:
11-2031/Q
开本:
16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1981-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
14991
总下载数(次)
0
相关基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金
英文译名:
官方网址:
项目类型:
学科类型:
期刊文献
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