土壤细菌群落密度实时荧光定量PCR检测体系的建立

• 作者: 刘爽 许艳丽 顾卿 魏巍
• 来源期刊: 土壤与作物
• 学科: 农学
• 关键词: 土壤微生物 实时荧光定量PCR 绝对定量
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 页码范围: 117-120
• 分类号: S154.3
• 字数: 2873字
• 语种: 中文

摘要

为了建立土壤环境样品中细菌群落的定量分析体系,选用了多环芳烃污染土壤处理P1和P2,以及无多环芳烃污染的裸地生态系统土壤C等3种处理,利用构建克隆子的方法制作标准样品,并对实时荧光定量PCR标准曲线的线性(R2)、扩增效率(E)以及斜率(S)等相关参数进行了优化.结果表明,标准曲线的线性R2=0.985、扩增效率E=101.7％以及斜率S=-3.282,均符合参数符合要求.土壤样品P1、P2和C的细菌16SrDNA片段拷贝数为1.4×109个·g-1、4.0×109个·g-1和5.0×109个·g-1.说明建立的实时荧光定量PCR检测体系可以灵敏地定量未知模板的土壤细菌数量.