基于线粒体16S rRNA与COI基因序列的刻肋海胆属系统发育研究

• 作者: 张文峰 曾晓起 高天翔
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 刻肋海胆属 细胞色素氧化酶Ⅰ(COI) 16S rRNA 系统发育
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 47-51
• 分类号: Q244
• 字数: 3402字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5174.2012.06.007

摘要

本研究以16S rRNA和细胞色素氧化酶I(Cytochrome oxidase subunit I,COI)基因片段序列为标记,以杂色角孔海胆(Salmacis sphaeroides)为外群,基于距离法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML)分别构建分子系统树,对刻肋海胆属(Temnopleu rus)进行了系统发育学研究.结果表明,哈氏刻肋海胆、细雕刻肋海胆、T.alexandri三者亲缘关系较近,芮氏刻肋海胆和T.michaelseni亲缘关系较近.两个基因片段的核苷酸替代速率顺序为COI＞ 16S rRNA.以3.49％/百万年的核苷酸分歧速率应用于5种海胆的COI基因片段,推断5种海胆分化事件主要发生在约500～590万年前,为中新世晚期(Late Miocene)或上新世早期(Early Pliocene).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾晓起	中国海洋大学水产学院	29	299	10.0	16.0
2	高天翔	中国海洋大学水产学院	154	2739	28.0	41.0
3	张文峰	中国海洋大学水产学院	3	20	3.0	3.0