小鼠基因内含子中CpG岛和几个转录调控元件分析

• 作者: 李慧敏 陈丹
• 来源期刊: 基因组学与应用生物学
• 学科: 生物学
• 关键词: 小鼠 内含子 CpG岛 调控元件 计算分析
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 129-132
• 页数: 4页
• 分类号: Q756
• 字数: 3209字
• 语种: 中文

摘要

内含子在基因转录调控中的作用已多次被实验报道,然而对其参与调控的普遍性还缺乏足够的理论支持。本研究利用计算分析方法,对小鼠基因内含子中的CpG岛（CpGisland）、TATA框（TATAbox）、CAAT框（CAATbox）以及GC框（GCbox）等元件的出现频率进行分析。结果发现,分别有56.01%、57.16%、65.88%和41.86%的第一内含子具有CpG岛、TATA框、CAAT框以及GC框,而它们在其它内含子中的平均出现频率则分别为14.07%、45.24%、49.91%和13.19%。即使考虑到不同位置的内含子,这些元件在第一内含子中的出现频率也显著高于它们在其它任何位置内含子中的出现频率。由于CpG岛、TATA框、CAAT框以及GC框均与基因的转录调控有关,据此推测小鼠第一内含子在基因转录调控过程中具有潜在的重要性。本研究结果为内含子参与转录调控提供了更多的理论依据。