格特隐球菌VGⅡ基因型的快速鉴定和序列分型研究

• 作者: 付小花 任大明 冯晓博 凌波 姚志荣 王磊
• 来源期刊: 中华临床感染病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 隐球菌属 基因型 聚合酶链反应 序列分析 基因内间隔区
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-4
• 分类号: R63
• 字数: 3418字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1674-2397.2012.01.001

摘要

目的 建立一种核糖体基因内间隔区(IGS)的特异性PCR扩增和序列分析方法,用于快速鉴定格特隐球菌VGⅡ基因型及其亚型.方法 选取新型和格特隐球菌核糖体IGS区中可变度最高的1区为靶点,经ClustalX 2多重比对后,设计特异性扩增格特隐球菌VGⅡ基因型的引物用于PCR分析.通过扩增新型和格特隐球菌其余基因型以及其他致病酵母菌来评价引物的特异性,并对阳性扩增片段(VGⅡ基因型)进行测序和序列分型研究.结果 基于核糖体IGS区的特异PCR引物扩增所有受试格特隐球菌VGⅡ基因型菌株均为阳性,而新型和格特隐球菌其余基因型以及其他致病酵母菌均为阴性.序列分型显示,在扩增片段的72、79和104 bp处存在3个多态性位点,可用于区分VGⅡ基因型中的不同亚型.结论 该研究建立的特异性PCR扩增方法可快速、准确地鉴定格特隐球菌VGⅡ基因型,对扩增片段的序列分型可初步筛查高致病性的VGⅡa亚型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王磊	同济大学环境科学与工程学院	374	3139	29.0	41.0
2	任大明	复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室	98	819	15.0	24.0
3	付小花	同济大学环境科学与工程学院	14	84	5.0	9.0