肺癌高转移和低转移细胞株中差异基因的分析

• 作者: 于静娴 刘蕾 姚明 张方淋 李静 林河春 萨冰清 闫明霞
• 来源期刊: 肿瘤
• 学科: 医学
• 关键词: 肺肿瘤 肿瘤转移 寡核苷酸序列分析 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 164-169
• 分类号: R734.2
• 字数: 4137字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3781/j.issn.1000-7431.2012.03.003

摘要

目的:以人肺癌低转移细胞株SPC-A-1为对照,分析人肺癌高转移细胞株SPC-A-1sci的分子转移机制及其相关的信号通路,寻找肺癌转移的关键基因.方法:应用芯片技术检测人肺癌低转移细胞株SPC-A-1和高转移细胞株SPC-A-1sci的差异基因.采用显著性通路分析和构建信号转导网络等生物信息学分析方法寻找肿瘤转移相关的潜在关键基因和信号通路.结果:与SPC-A-1细胞比较,SPC-A-1sci细胞共有上调表达的差异基因2 892个,下调表达的差异基因3 248个；上调差异基因参与的显著性信号转导通路共有48条,下调差异基因参与的显著性信号转导通路共65条.网络中的关键基因主要是丝裂原活化蛋白激酶1、表皮生长因子受体、AKT1、AKT3、PIK3CD( phosphoinositide-3-kinase,catalytic,delta polypeptide)、PIK 3R1 [phosphoinositide-3-kinase 3,regulatory subunit 1 (alpha)]、PIK 3R3、KRAS和胰岛素样生长因子1受体等.结论:人肺癌高转移细胞株SPC-A-1sci的基因芯片检测和生物信息学分析为肺癌转移的基础研究和临床防治提供了依据.