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马铃薯SGAs合成代谢途径末端SGT酶基因克隆及序列分析
马铃薯SGAs合成代谢途径末端SGT酶基因克隆及序列分析
作者:
张俊莲
张金文
牛继平
王旺田
王蒂
陆艳梅
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
马铃薯
糖苷生物碱
茄啶糖苷转移酶
基因克隆
生物信息学分析
摘要:
糖苷生物碱(SGAs)是一类存在于茄科植物和百合科植物的重要次生代谢物,与植物抗逆性和产品品质有密切关系,同时在医药上具有广泛的药理学活性.茄啶:糖基转移酶(SGT)为SGAs合成代谢途径末端关键酶,研究其基因结构及其编码的酶蛋白特性,对于调控植物体内SGAs合成及其通过微生物发酵生产SGTs有重要的作用和意义.通过生物信息学分析方法预测3个糖基转移酶cDNA编码的酶蛋白结构和特性.以马铃薯块茎表皮总RNA为模板,采用RT-PCR的方法扩增出3个糖基转移酶(SGT1、SGT2和SGT3)基因片段并克隆到pMDR 19-T载体.阳性克隆经PCR鉴定后进行测序,序列分析结果表明,克隆到的sgt1、sgt2和sgt3三个同源的序列片段(1 467~1 518 bp),编码488~505个氨基酸;所得序列与GenBank中注册的高等植物SGT酶基因核苷酸序列(U82367.2、DQ 218276.1和DQ 266437)的同源性均在99.12%以上,氨基酸同源性达到99%以上,3个基因都具有UDPG糖基转移酶保守结构域及许多重要功能位点;PI为5.52~5.62.三级结构预测表明,该氨基酸同糖基转移酶单体结构模型相似,都为糖基转移酶家族成员,具有合成类固醇糖苷生物碱的功能,基因序列已注册到GenBank,序列注册号分别为:sgtl,JN695005;sgt2,JN695006;sgt3,HM188447.
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基因克隆
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抗病性鉴定
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文献信息
篇名
马铃薯SGAs合成代谢途径末端SGT酶基因克隆及序列分析
来源期刊
草业学报
学科
农学
关键词
马铃薯
糖苷生物碱
茄啶糖苷转移酶
基因克隆
生物信息学分析
年,卷(期)
2012,(3)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
106-116
页数
分类号
Q943.2|S532.03
字数
5581字
语种
中文
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基因克隆
生物信息学分析
研究起点
研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
草业学报
主办单位:
中国草原学会
兰州大学草地农业科技学院
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-5759
CN:
62-1105/S
开本:
大16开
出版地:
兰州市嘉峪关西路768号(兰州市61号信箱)
邮发代号:
54-84
创刊时间:
1990
语种:
chi
出版文献量(篇)
4091
总下载数(次)
7
总被引数(次)
81391
相关基金
甘肃省自然科学基金
英文译名:
Natural Science Foundation of Gansu Province
官方网址:
http://www.nwnu.edu.cn/kjc/glbf/gsshzrkxjjzxglbf.htm
项目类型:
学科类型:
期刊文献
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