重复序列PCR与多位点分型技术在热带假丝酵母菌基因分型中的比较

• 作者: 俞焙秦 彭奕冰 江岑 董丹凤
• 来源期刊: 检验医学
• 学科: 生物学
• 关键词: 热带假丝酵母菌 REP-PCR MLST 基因分型
• 年，卷（期）: 2012,（11）
• 所属期刊栏目: 分子生物学检验论著
• 页码范围: 917-920
• 页数: 4页
• 分类号: Q503
• 字数: 3078字
• 语种: 中文

摘要

目的 分析比较重复序列聚合酶链反应(REP-PCR)与多位点分型技术(MLST)在热带假丝酵母菌基因分型中的应用.方法 收集来自5个地区6家医院的147株热带假丝酵母菌,分别以Ca-21、Ca-22、Com-21两两组合为引物,选用最合适的引物对进行 REP-PCR后通过电泳获得REP-PCR型.在不同型别中各挑选3株采用MLST法扩增热带假丝酵母菌的6个管家基因,扩增片段测序后与数据库比对得到相应的序列型(sequence type,ST).结果 REP-PCR以Com21-Com21为引物对分型效果最好,REP-PCR与MLST分型结果一致.147株热带假丝酵母菌产生A～H共 8种REP-PCR型,分别对应MLST的ST146、新型1、ST136、ST127、ST177、ST169、新型2和ST117.结论 REP-PCR与MLST在热带假丝酵母菌的基因分型中分辨率相同,而REP-PCR更为方便迅速,可作为实验室大量菌株分型的首选方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	俞焙秦	上海交通大学医学院附属瑞金医院检验科	5	80	3.0	5.0
2	彭奕冰	上海交通大学医学院附属瑞金医院检验科	40	225	8.0	13.0
3	董丹凤	上海交通大学医学院附属瑞金医院检验科	11	76	4.0	8.0
4	江岑	上海交通大学医学院附属瑞金医院检验科	10	48	4.0	6.0