波纹唇鱼 mtDNA D-loop 序列变异分析

• 作者: 尹绍武 朱晓平 祝斐 胡亚丽 胡静 骆剑 齐兴柱
• 来源期刊: 海洋科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 波纹唇鱼(Cheilinus undulatus) mtDNA D-loop 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 页码范围: 50-56
• 分类号: Q953
• 语种: 中文

摘要

为研究波纹唇鱼(Cheilinus undulatus)线粒体 D-loop 序列遗传多样性,作者采用聚合酶链式反应和克隆技术对海波纹唇鱼群体(n=25)的 mtDNA D-loop 序列进行克隆和测序,获得长度大约为1400 bp的产物.用 ClustalX 软件进行排序比较,将结果导入 MEGA5.0,结果显示出在这25尾个体中,共检测出66个变异位点,包括0个碱基缺失,4个碱基插入,59转换位点,2颠换位点及1个转换和颠换同时存在的位点.并用 MEGA5.0软件构建该群25尾个体的 NJ 和 UPGMA 系统树.由 DNASP 软件计算出该波纹唇鱼群体的多态位点数(S)为62,核苷酸多样性(Pi)为0.00606,平均核苷酸差异数为6.907.结果表明波纹唇鱼群体的 mtDNA-loop 基因个体差异程度不明显