鳀科鱼类线粒体全基因组序列结构特征及系统发育信息分析

• 作者: 张丽丽 程起群
• 来源期刊: 海洋渔业
• 学科: 生物学
• 关键词: 鳀科 线粒体 基因组特征 自然选择 系统进化
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 7-14
• 分类号: Q244
• 字数: 5433字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-2490.2012.01.002

摘要

为了解鳀科鱼类的线粒体全基因组序列结构特征及系统发育信息,以期为进化遗传学研究和分子标记的选取提供参考依据,对已知的10种鳀科鱼类的线粒体全基因组进行分析.结果显示:1)鳀科线粒体基因组全序列长度在16 660 bp到17 069 bp之间,基因组的结构和基因排列顺序与其它硬骨鱼类一致.2)比对后获得一致序列长度为15 704 bp(不含D-loop),其中变异位点5 570个,占所有位点数的35.5％.在编码基因中,序列变异程度和Kimura双参数遗传距离最大的是ND6基因(分别是47.5％和0.276),最小的是tRNA拼接序列(分别为18.7％和0.072).3)基于Ka-Ks的Z检验和Tajima's D检验表明蛋白质编码基因主要受到净化选择(即负选择,purifying selection)的作用；其中12个蛋白质编码基因(ND6除外)有强烈的净化选择(Ka/Ks＜1),而ND6基因受正选择(positive selection)影响较大(Ka/Ks＞1).4)ND4、ND2和Cytb是进行鳀科鱼类系统发育分析的较为理想的分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程起群	农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室中国水产科学研究院东海水产研究所	8	156	6.0	8.0
2	张丽丽	农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室中国水产科学研究院东海水产研究所	2	21	2.0	2.0