猪LBP基因电子克隆及生物信息学分析

• 作者: 傅聪 喻礼怀 王靖 王龙 顾雯雯
• 来源期刊: 扬州大学学报（农业与生命科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 LBP基因 电子克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 页码范围: 28-32
• 页数: 5页
• 分类号: S828.2
• 字数: 4113字
• 语种: 中文

摘要

利用电子克隆技术,以人脂多糖结合蛋白(LBP)基因(NM 004139)为种子序列,克隆猪LBP基因.结果表明:所克隆的LBP基因开放阅读框长为1 446 bp,编码481个氨基酸.推导其氨基酸序列与人、小鼠、大鼠、牛、狗的相似性分别为74.2％、64.8％、63.2％、77.1％和74.6％.进化树分析显示,猪与牛LBP基因进化距离最近,与大鼠最远.生物信息学分析表明,所克隆的猪LBP蛋白分子大小为53.036 7 ku,理论等电点为6.43；亚细胞定位预测猪LBP属于分泌蛋白,主要在线粒体(44.4％)和高尔基体(22.2％)中表达；N端存在信号肽,且在25～26位氨基酸可能存在裂解位点.N端的疏水性较强,且位于信号肽处,最大疏水性值为2.478,最大亲水性值为1.956;由胞外区(1～6位氨基酸)、跨膜区(7～29位氨基酸)和胞内区(30～481位氨基酸)3个部分组成的膜蛋白,有9个Ser、8个Thr和2个Tyr,可能成为蛋白激酶磷酸化的位点；LBP膜外区蛋白由多个α螺旋,膜内区由多个β折叠构成,α螺旋和β折叠平行交替排列,构成一个弯曲螺旋状结构；在33～256和271～474位氨基酸残基之间分别有1个BPI1和BPI2的保守结构域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	喻礼怀	扬州大学动物科学与技术学院	98	467	12.0	14.0
2	王龙	扬州大学动物科学与技术学院	20	34	5.0	5.0
3	王靖	扬州大学动物科学与技术学院	4	14	3.0	3.0
4	顾雯雯	扬州大学动物科学与技术学院	9	32	4.0	5.0
5	傅聪	扬州大学动物科学与技术学院	1	5	1.0	1.0