烟草类胡萝卜素双加氧裂解酶基因的克隆与序列分析

• 作者: 夏庆友 段军 王根洪 程廷才 高军平
• 来源期刊: 烟草科技
• 学科: 农学
• 关键词: 烟草 CCD4基因 RT-PCR 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 所属期刊栏目: 烟草农学
• 页码范围: 75-81
• 分类号: S572
• 字数: 4050字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-0861.2012.09.017

摘要

为揭示类胡萝卜素双加氧裂解酶基因(CCDs)在烟草生长发育过程中的功能,通过RT-PCR技术克隆到烟草的类胡萝卜素双加氧裂解酶4基因(NtCCD4),编码区1806 bp,编码601个氨基酸,基因序列提交NCBI,GenBank登录号为JF947192.根据氨基酸组成对NtCCD4基因编码蛋白的疏水性/亲水性、蛋白结构及进化关系等进行预测和分析.结果表明:烟草NtCCD4基因编码的蛋白分子量为65936.3 Da,等电点为6.58,定位在叶绿体膜上,为一个稳定的亲水性蛋白；二级结构预测显示此蛋白结构以无规则卷曲(57.4％)为主,α螺旋(13.31％)和β转角(6.61％)所占比例相对较少；进化分析表明NtCCD4是类胡萝卜素双加氧裂解酶基因( CCDs)家族中的一个成员,与其他物种的CCD4蛋白比较显示NtCCD4编码的蛋白含有多个保守区域,其中4个组氨酸残基是组成蛋白功能域所必须的,它们与Fe2+结合共同组成蛋白酶的活性中心.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程廷才	重庆大学农学及生命科学研究院	8	53	3.0	7.0
3	夏庆友	西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室	103	602	14.0	20.0
4	王根洪	重庆大学农学及生命科学研究院	4	20	2.0	4.0
10	段军	重庆大学农学及生命科学研究院	18	38	4.0	5.0
12	高军平	重庆大学农学及生命科学研究院	1	7	1.0	1.0