酿酒酵母SNF4基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 吴毕莎 林晓华 林清强 柯崇榕 陈由强 黄建忠
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 工学
• 关键词: SNF4 酿酒酵母 ADH2 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 页码范围: 8-11
• 分类号: TQ926.1
• 字数: 2868字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2012.01.03

摘要

SNF4基因编码的Snf4p具有调节Snf1复合体的蛋白激酶活性功能,根据已知的SNF4基因序列设计引物扩增获得S.cerevisiae YS2的SNF4基因完整序列.序列分析表明,SNF4基因的开放阅读框为969bp,编码322个氨基酸残基.应用生物信息方法预测其理化性质、疏水性、信号肽、亚细胞定位、活性位点及其高级结构.结果表明:Snf4p为具有一定亲水性的非跨膜胞内稳定酸性蛋白,功能结构域为CBS_pair superfamily结构域,二级结构主要由a-螺旋组成,空间结构是由4个CBS结构域构成两个CBS对围绕形成的二聚体.Snf4p的第一个CBS对区域的β片层结构是Snf1p、Sip2p的β发夹结构结合作用区.