森林草莓全基因组WRKY转录因子基因的鉴定与分析

• 作者: 张豫超 杨肖芳 苗立祥 蒋桂华
• 来源期刊: 核农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓 WRKY转录因子 全基因组 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 1124-1131
• 分类号: S511.01
• 语种: 中文

摘要

WRKY转录因子是一类重要的调控分子,在高等植物中以基因家族的形式存在。本研究以森林草莓基因组数据为材料,利用生物信息学手段对WRKY转录因子进行全基因组鉴定与分析。结果表明,森林草莓至少有56个WRKY转录因子,蛋白序列长度为58～1982个氨基酸;基因组DNA全长1092～14227bp,具1～20个内含子。染色体定位结果表明,7条染色体上均有WRKY转录因子基因的分布,6号染色体上最多（17）,1号染色体分布最少（1）。森林草莓WRKY转录因子可分为3大类,Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为10、34和12,它们处于进化树的不同分支。除保守的WRKYGQK和常见变异序列WRKYGKK外,新发现WKKYGQK、WRKSYFR等WRKY结构域类型。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苗立祥	浙江省农业科学院园艺研究所	50	195	7.0	11.0
2	蒋桂华	浙江省农业科学院园艺研究所	74	776	19.0	25.0
3	张豫超	浙江省农业科学院园艺研究所	36	213	7.0	13.0
4	杨肖芳	浙江省农业科学院园艺研究所	45	211	7.0	12.0