利用PCR-DGGE技术分析桑天牛成虫肠道细菌菌群

• 作者: 李会平 苏筱雨 袁秀洁
• 来源期刊: 蚕业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 桑天牛 肠道细菌 16S rDNA序列 PCR-DGGE技术
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 41-45
• 分类号: S888.72|Q939.12
• 字数: 4747字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0257-4799.2012.01.008

摘要

利用PCR-DGGE技术分析桑天牛成虫肠道菌群结构及优势菌群,获取桑天牛肠道微生物的多样性信息.从桑天牛成虫肠道中提取细菌基因组DNA,以细菌16S rDNA基因通用引物27F/1495R和27 F/519r+ GC进行V3可变区PCR扩增,将长约500 bp的扩增产物经变性梯度凝胶电泳(DGGE)分离后,进行优势条带分析、DNA回收、克隆、测序等,初步得到分别属于肠杆菌属(Enterobacter)、不动杆菌属(Acinetobacter)、埃希氏菌属(Escherichia)、志贺菌属(Citrobacter)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、柠檬酸菌属(Shigella)、泛菌属(Pantoea)和沙雷氏菌属(Serratia)的8个细菌菌株,其中优势细菌为克雷伯氏菌属的细菌菌株,其次是沙雷氏菌属的细菌菌株.将获取的细菌16S rDNA序列在GenBank数据库中进行BLAST比对分析,相似度在97％以上的有6个菌株,其中有5个菌株与传统方法分离菌株的鉴定结果一致,表明基于16S rDNA的PCR-DGGE技术可用于桑天牛肠道菌群多样性研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李会平		65	696	16.0	24.0
3	袁秀洁		4	20	3.0	4.0
4	苏筱雨		38	206	8.0	12.0