两位点疾病模型的快速参数求解算法

• 作者: 刘新求 杨洋 谢民主
• 来源期刊: 计算机工程
• 学科: 工学
• 关键词: 单核苷酸多态性 边缘效应 多基因交互 发病概率 全基因组关联分析 二分搜索
• 年，卷（期）: 2012,（19）
• 所属期刊栏目: 开发研究与设计技术
• 页码范围: 266-268,273
• 分类号: TP301.6
• 字数: 3830字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3428.2012.19.068

摘要

生成模拟数据对全基因组关联分析(GWAS)算法进行测试时,要求按单位点边缘效应大小计算出疾病模型的相关参数,而目前缺乏对应的公开算法.为此,基于二分搜索提出一个数值算法,根据单位点边缘效应和人群疾病发病率计算出3个典型的两位点疾病模型的控制参数.实验结果表明,该算法能快速精确地进行疾病模型参数求解,便于对GWAS算法进行大规模模拟测试.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢民主	湖南师范大学物理与信息科学学院	16	88	4.0	9.0
2	杨洋	湖南师范大学物理与信息科学学院	15	27	2.0	5.0
3	刘新求		14	15	2.0	3.0