柄海鞘共附生细菌的分离培养与系统发育多样性研究

• 作者: 杜宗军 苗婷婷 邢翔 陈冠军
• 来源期刊: 海洋科学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 柄海鞘 共附生细菌 16S rRNA基因 系统发育分析 细菌多样性
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 111-118
• 分类号: Q938.1
• 字数: 4403字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-6647.2012.01.014

摘要

通过纯培养和16S rRNA基因序列的相似性比对,并构建系统发育树对威海海域柄海鞘共附生细菌的多样性进行了研究.用2216E培养基从柄海鞘样品中分离到78株细菌,通过形态学特征和TCBS培养基选择性筛选后,选取30株具有代表性的菌株进行了16S rRNA基因测序和基于16S rRNA基因序列的系统发育多样性分析.结果表明,30株菌株分别属于细菌域的4个系统发育类群(Actinobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes,Groteobacteria)的11个科,11个属.根据16S rRNA基因序列,大多数菌株与其系统发育关系最密切的模式菌株之间存在一定的遗传差异(16S rRNA基因序列相似性为91.82％～98.93％).其中菌株HQW7,HQYD1,HQWD4,HQE1和HQE2与相关模式菌株的16S rRNA基因最高相似度仅分别为91.82％,92.51％,92.99％,93.52％,93.87％,这5株菌可能代表新的分类单元.威海海域柄海鞘共附生细菌存在着较为丰富的物种多样性和系统发育多样性,并可能存在新的物种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜宗军	山东大学威海分校海洋学院	16	97	6.0	9.0
2	陈冠军	山东大学威海分校海洋学院	43	833	16.0	28.0
3	苗婷婷	山东大学威海分校海洋学院	4	20	2.0	4.0
4	邢翔	山东大学威海分校海洋学院	17	38	3.0	6.0