家蚕新的非编码RNA功能初探

• 作者: 刘卫群 刘宗才 张琨 李丹丹 阚云超
• 来源期刊: 信阳师范学院学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 家蚕 非编码RNA 丝腺
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 生物多样性与生态环境
• 页码范围: 490-494
• 分类号: Q522
• 字数: 3107字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-0972.2012.04.017

摘要

构建了家蚕50 ～ 500 nt非编码RNA的cDNA文库,发现了189个新的ncRNA,其中一个小RNA-Bm-86在家蚕幼虫和蛹中的表达量显著高于卵和成虫.利用生物信息学软件对该ncRNA的特性及其与上下游基因的关系进行了深入分析,并利用Northern杂交和半定量RT-PCR技术对该ncRNA与其宿主基因在家蚕不同组织的表达情况进行了研究.结果发现,该ncRNA属于H/ACA box snoRNA家族,是由家蚕eIF5A基因的第二个内含子转录产生的,且在家蚕中没有明显的靶标位点.分析其上下游基因结构发现,在其上游263 bp处存在着一个可能的启动子位点,表明其有独立转录的倾向.进一步分析Bm-86与其宿主基因eIF5A在家蚕不同组织部位的表达情况发现,二者在表达上存在着负相关的关系,且该现象在丝腺中尤其明显.推测Bm-86可能通过影响eIF5A基因的表达参与到家蚕丝腺发育调控过程中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘卫群	河南农业大学生命科学学院	94	1777	23.0	39.0
2	阚云超	南阳师范学院河南省伏牛山昆虫生物学重点实验室	32	176	6.0	12.0
3	李丹丹	南阳师范学院河南省伏牛山昆虫生物学重点实验室	13	39	4.0	6.0
4	刘宗才	南阳师范学院河南省伏牛山昆虫生物学重点实验室	21	131	8.0	11.0
5	张琨	河南农业大学生命科学学院	9	27	3.0	5.0