水稻重组自交系分子遗传图谱构建及分蘖角的QTL检测

• 作者: 周丽慧 姚姝 张亚东 张颖慧 朱镇 王才林 董少玲 赵凌 赵庆勇 陈涛
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 重组自交系 分子遗传图谱 分蘖角 QTL SSR
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·耕作栽培·生理生化
• 页码范围: 236-242
• 分类号: S511.032
• 字数: 4163字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2012.02.002

摘要

利用株型差异显著的特大粒粳稻品系TD70和籼稻小粒品种Kasalath为亲本配制组合,以单粒传方法构建含240个株系的重组自交系( RIL)群体.选用838对SSR引物进行亲本多态性筛选,共检测到302对具有多态性的引物,频率为36.04％.从中选择带型清晰且在基因组中均匀分布的141个SSR标记对RIL群体进行基因型分析,结果表明:群体中父母本基因频率分别为53％和47％,群体结构平衡性好.构建的水稻分子连锁图谱共包含141个标记座位,总图距约1 832.47 cM,标记间平均图距为12.7 cM,标记间图距范围为0.43 ～36.11 cM,符合QTL作图的基本要求.除第1、第8染色体个别标记位置外,其他染色体上标记顺序和位置与已公布的日本晴遗传图谱序列基本一致.以该群体为材料,对分蘖角度进行了QTL检测,共检测到控制分蘖角度的3个QTL位点,分别是qTA8、qTA9和qTA11,贡献率分别为4.10％、26.08％和4.35％,其中qTA9包含控制水稻分蘖角度基因TACI.该图谱的构建为研究籼粳交后代各种性状的遗传规律及QTL定位打下了基础.