利用SCoT标记分析不同秋眠型苜蓿的遗传多样性

• 作者: 何庆元 向仕华 周丽英 杨红燕 王吴斌 王松华
• 来源期刊: 草业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苜蓿 SCoT 条件优化 秋眠型 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 133-140
• 分类号: S816|S551+.703
• 字数: 5597字
• 语种: 中文

摘要

用L16 (45)正交实验设计研究模板DNA、dNTPs、Mg2+、Taq酶和引物5个因素的浓度对SCoT扩增迁移率重现率的影响.结果表明,在20 μL反应体系中,2.5 ng/μL DNA、1.00 mmol/L Mg2+、1.20 UTaq酶、0.40mmol/L dNTPs和0.30 μmol/L浓度的引物最为稳定,重现率达到100％.利用最优反应体系从50条引物中筛选出13条扩增效果好的引物,将它们分别扩增34个苜蓿品种,共检测到103个SCoT标记,其中92个位点具有多态性.聚类分析表明,从安徽和江苏两地收集的野生南苜蓿和栽培苜蓿的遗传距离最远,单独聚为一类；其余32个品种苜蓿在相似系数0.757附近分为3个亚群,秋眠型苜蓿品种主要分布在第Ⅱ亚群中,半秋眠型在3个亚群中都有分布,而非秋眠型苜蓿分布在第一和第二亚群中,表明SCoT标记的聚类结果在一定程度上能够反映苜蓿的秋眠型,但并不完全一致.