野生铁皮石斛rDNA ITS序列分析

• 作者: 刘鹏 张丹雁 张建霞 张桂芳 李海霞 赖小平 陈念 黄松 黄海波
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 关键词: 铁皮石斛 内转录间隔区 系统发育分析 物种鉴定
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 页码范围: 2044-2049
• 字数: 3389字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-3849.2012.05.018

摘要

目的:测定和分析不同产地野生铁皮石斛样品的rDNA ITS序列,探讨利用ITS序列推测铁皮石斛样品产地来源的可行性.方法:提取总基因组DNA,使用通用引物ITS5F/ITS4R进行PCR扩增,产物经电泳检测、纯化和测序后用Sequin 11.0提交GenBank.用Bioedit 7.0中的Clustal W对GenBank中包括本研究提交的11条在内的所有33条铁皮石斛的ITS序列进行多重序列比对,随后以金钗石斛和密花石豆兰为外群,用邻接法构建NJ系统发育树.结果:从所有测定的ITS序列中选择11条提交GenBank,获得登录号JF803235~JF803245.所有铁皮石斛经比对后共发现645个同源位点,9个信息位点(ITS1区3个,5.8 S区4个,ITS2区2个).系统发育分析发现,金钗石斛和密花石豆兰位于树的基部,另外32条铁皮石斛共同形成单个大的分支,未发现产地来源与系统树的拓扑结构之间存在对应关系.结论:由于缺乏完善的铁皮石斛标准品及其DNA参考序列的提交标准,同时单个ITS序列仅能提供有限的系统发育信息位点,因此通过ITS序列分析的方法推测铁皮石斛样品的产地来源目前尚不具有可行性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖小平	广州中医药大学中药学院	353	3650	27.0	44.0
2	张丹雁	广州中医药大学中药学院	76	387	9.0	16.0
3	黄海波	广州中医药大学中药学院	40	304	10.0	15.0
4	黄松	广州中医药大学中药学院	81	611	14.0	20.0
5	刘鹏	广州中医药大学中药学院	26	106	6.0	10.0
6	陈念	广州中医药大学中药学院	13	81	6.0	8.0
7	张桂芳	广州中医药大学中药学院	34	221	9.0	12.0
8	李海霞	广州中医药大学中药学院	11	27	4.0	4.0