香蕉植株内生细菌群落的PCR—DGGE分析

• 作者: 于莉 刘勇勤 刘菲菲 李赤
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 香蕉 内生细菌 DGGE 群落结构 多样性
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 235-240
• 页数: 6页
• 分类号: S668.1
• 语种: 中文

摘要

以健康香蕉植株和感染香蕉枯萎病菌Fusarium oxysporum f．sp．cubense（FOC）后的香蕉植株的根茎叶组织为材料，提取样品中的总DNA，扩增细菌的16SrDNA的V-3可变区，对扩增产物进行DGGE电泳分析，并对其中18条优势条带进行切胶回收、克隆测序和系统发育分析。结果表明，香蕉健株与病株各组织中所含内生细菌的种群丰富度为根部〉假茎〉if片：感病植株组织内生细菌种类比健康植株丰富；BLAST结果为大部分克隆序列与已知细菌16SrDNA基因序列的同源性较高（94％～100％），分别归属于蓝细菌门（Cyanobacteria）、绿弯菌门（Chloroflexi）、放线菌门（Actinobacteria）、变形杆菌门（Proteobacterium）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）和绿菌门（Chlorobi）7大类群；其中一个序列同源性较低（91％），可能代表新的分类单元。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李赤		11	147	7.0	11.0
2	于莉		29	291	9.0	16.0
3	刘菲菲		3	5	1.0	2.0
4	刘勇勤		2	5	1.0	2.0