中国棉花主栽品种DNA指纹数据库初步构建研究

• 作者: 冯新爱 匡猛 周大云 张玉翠 杨伟华 王延琴 王飞 苏畅 许红霞
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 DNA指纹数据库 SSR 荧光检测
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 229-237
• 分类号: S562.035.3
• 字数: 7548字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-7807.2012.03.006

摘要

基于多重PCR( Polymerase chain reaction)与毛细管五色荧光检测系统,利用36对核心引物构建了138份棉花主栽品种DNA指纹数据库,采用棉花DNA指纹数据库软件管理系统进行数据统计与分析.36对引物在138份材料中共扩增出143个多态性等位位点,每对引物的等位位点数为2～8个,平均每对引物扩增出3.97个多态性等位位点.抽查的101个主栽品种仅45.6％的位点完全纯合,中棉所系列品种61.6％的位点完全纯合.存在5种非纯合位点表现形式,以2种基因型混杂所占比例最大,其中以5∶1的混杂类型最多.4种类型的同名品种指纹比对分析表明,品种内的遗传变异度均在0～2个差异位点.初步建立了高通量的棉花DNA指纹检测与数据分析平台,提出了不同品种间的差异判别标准.