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温度刺激对斑马鱼仔鱼基因转录表达的影响
温度刺激对斑马鱼仔鱼基因转录表达的影响
作者:
崔宗斌
李林春
李青
龙勇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
温度刺激
斑马鱼
基因表达
基因芯片
摘要:
许多优良鱼类养殖品种不耐低温或高温的特点给水产养殖业带来诸多限制和困难,这些鱼类在胚胎和仔鱼等早期阶段的抗寒和抗热能力比成体更差,育苗过程中很容易受到温度突然变化的影响.虽然目前利用基因芯片技术已研究了温度刺激对几种鱼类成体组织中基因表达的影响,但温度刺激对仔鱼基因转录表达的影响还未见报道.研究以斑马鱼受精后96h的出膜仔鱼为实验材料,分别在低温(16℃)和高温(34℃)条件下处理12h和24h,用基因芯片技术检测温度刺激对其基因表达的影响.与培养在28℃的对照相比,低温和高温处理后共有3633个基因发生差异表达,其中低温处理后差异表达基因数目多于高温处理,而且低温抑制基因数目多于诱导表达基因的数目.生物信息学分析结果表明,低温诱导基因主要参与RNA加工和核糖体生物发生等生物学过程,高温诱导基因则主要参与应激反应和未折叠蛋白结合.低温抑制基因主要参与蛋白质水解、视觉感知以及铁离子结合等生物学功能,高温抑制基因参与的生物学功能包括DNA复制、神经系统过程和类固醇激素生物合成等.除了已报道的温度刺激响应基因外,研究鉴定出了大量尚未报道与温度刺激相关的基因,如参与RNA加工的rnmtlla和pus3基因,以及参与转录调控的twistnb和aebp2基因等.研究结果为进一步揭示鱼类冷或热适应的分子机理和培养耐寒或耐热的养殖新品种提供理论基础.
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文献信息
篇名
温度刺激对斑马鱼仔鱼基因转录表达的影响
来源期刊
水生生物学报
学科
生物学
关键词
温度刺激
斑马鱼
基因表达
基因芯片
年,卷(期)
2012,(5)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
882-891
页数
10页
分类号
Q786
字数
7239字
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1035.2012.00882
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李青
中国科学院水生生物研究所
142
948
15.0
24.0
2
崔宗斌
中国科学院水生生物研究所
9
198
7.0
9.0
3
龙勇
中国科学院水生生物研究所
3
22
2.0
3.0
4
李林春
16
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传播情况
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斑马鱼
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基因芯片
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
水生生物学报
主办单位:
中国科学院水生生物研究所
中国海洋湖沼学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-3207
CN:
42-1230/Q
开本:
大16开
出版地:
湖北省武汉市武昌珞珈山水生所 (武昌东湖南路7号)
邮发代号:
82-329
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
3348
总下载数(次)
8
总被引数(次)
54594
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