西伯利亚鲟CXCR7基因cDNA全长的克隆及其表达分析

• 作者: 施志仪 李巍 轩兴荣 郭大庆
• 来源期刊: 海洋渔业
• 学科: 生物学
• 关键词: 西伯利亚鲟 CXCR7 cDNA克隆 序列分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 241-248
• 分类号: Q344
• 字数: 5648字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-2490.2012.03.001

摘要

采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE),首次克隆了西伯利亚鲟(Acipenser baerii)的CXCR7a和CXCR7b基因的全长cDNA.CXCR7a的cDNA全长为2 325 bp(登录号为:JQ034508),包括207 bp的5 '端非翻译区(UTR)、可编码362个氨基酸的1 086 bp的开放阅读框(ORF)及包括poly(A)尾巴在内的大小为1 032 bp的3 '端非翻译区(UTR)；CXCR7b的cDNA全长为2 423 bp(登录号为:JQ034509),包括209 bp的5'端非翻译区(UTR)、可编码370个氨基酸的1 110 bp的开放阅读框(ORF)及包括poly(A)尾巴在内的大小为1 104bp的3'端非翻译区(UTR),并对它们编码的蛋白质序列的分子特征进行了分析.氨基酸序列相似性(similarity)分析表明,CXCR7a与人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)、非洲爪蟾(Xenopus laevis)、斑马鱼(Danio rerio)的CXCR7相似性分别为82.6％、81.4％、80.9％、81.0％；CXCR7b与人、小鼠、非洲爪蟾、斑马鱼的CXCR7相似性分别为82.9％、82.3％、80.8％、82.5％；西伯利亚鲟CXCR7a与其CXCR7b的相似性最高为96.5％.系统进化树分析显示,西伯利亚鲟与斑马鱼聚为一簇,两栖类聚为一簇,其它高等脊椎动物再进行聚类.对CXCR7a和CXCR7b在各发育时期胚胎及仔鱼的表达状况分别进行定性分析表明,CXCR7a在除卵裂期、囊胚期的胚胎外,其在原肠胚中期至出膜1d的仔鱼的各时期中均具有表达,CXCR7b在卵裂期至出膜1d的仔鱼的各时期中均具有表达.另外,从基因组DNA水平上表明CXCR7a和CXCR7b来自不同的基因拷贝.这些结果为进一步研究CXCR7在西伯利亚鲟侧线系统发育中的作用提供了新的基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	施志仪	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	48	217	9.0	11.0
2	李巍		14	91	6.0	9.0
3	轩兴荣	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	12	28	3.0	4.0
4	郭大庆	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	1	1	1.0	1.0