应用质谱技术检测结肠癌细胞DPYD和MTHFR基因单核苷酸多态性

• 作者: 丁家华 仲悦娇 冯继峰 张孝平 张文静 彭苗新 柏志斌 程璐 陆祖宏 陈宝安 高冲 鲍文
• 来源期刊: 癌变·畸变·突变
• 学科: 生物学
• 关键词: 结肠癌 单核苷酸多态性 DPYD MTHFR
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 96-99,107
• 分类号: Q754
• 字数: 2743字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-616x.2012.02.004

摘要

目的:检测结肠癌细胞株中两种代谢相关基因DPYD和MTHFR的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs).方法:培养HT-29及Lovo两株结肠癌细胞,分别提取基因组DNA,PCR扩增DPYD和MTHFR基因相应目的片段,采用基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术进行DPYD因rs1801159(A/G)、rs1801160(G/A)、rs17376848(A/G),MTHF基因rs1801131 (A/C)、rs1801133 (C/T)、rs2274976 (G/A)的SNPs位点检测.结果:两种细胞的DPYD基因3个位点rs1801159、rs1801160及rs17376848基因型均为野生纯合型,即A/A、G/G及A/A型.HT-29细胞MTHFR基因rs1801131和rs1801133、rs2274976位点基因型分别为A/C、C/T杂合子和G/G纯合子,而Lovo细胞此3个位点依次为A/A、T/T纯合子和G/A杂合子.结论:本实验中HT-29及Lovo两种细胞株的DPYD基因所测3个SNP位点基因型均相同,而这两种结肠癌细胞株MTHFR基因所测的各SNP位点基因型均不相同.