广州地区新型H1N1流感病毒PB1-F2基因进化和变异分析

• 作者: 何霞 关琳琳 冯发深 张定梅 徐霖 曹开源 王铸 邓瑜
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 新型H1N1流感病毒 PB1-F2 进化分析
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 317-323
• 页数: 7页
• 分类号: R373.1
• 语种: 中文

摘要

比较和分析2009～2011年广州地区分离到的甲型H1N1流感病毒PB1-F2基因和世界各地甲型H1N1流感病毒PB1-F2基因的变异情况,为该蛋白的功能和作用机制奠定基础.对分离自中国广州地区2009～2011年人类感染的17株新型H1N1和1株季节性H1N1流感病毒进行了PB1-F2基因克隆和序列测定,通过与GenBank数据库中68株人类新型H1N1和季节性H1N1流感病毒参考株的PB1-F2基因进行比对.结果表明,甲型流感病毒的PB1-F2基因进化树形成了2个不同的进化分支.全部2009～2011年新型H1N1流感病毒为一分支.广州地区PB1-F2基因与其它地区分离到的新型H1N1流感病毒具有高度的同源性,均为截短型变异.本实验室分离的1株季节性H1N1流感病毒也发生了第12位氨基酸截短突变.广州地区新型H1N1流感病毒PB1-F2截短蛋白与其它地区病毒相比未发生氨基酸变异,季节性H1N1流感病毒发现类似新型H1N1流感病毒PB1-F2的截短变异,提示新型H1N1流感病毒和季节性H1N1流感病毒PB1-F2可能发生早期重组.