甜瓜化感自毒作用响应基因的cDNA-AFLP分析

• 作者: 孙志浩 张志忠 林文雄 陈文辉
• 来源期刊: 中国生态农业学报(中英文)
• 关键词: 甜瓜 化感自毒作用 cDNA-AFLP 差异表达转录衍生片段 半定量RT-PCR 化感基因
• 年，卷（期）: 2012,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1514-1520
• 页数: 7页
• 分类号: S652.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1011.2012.01514

摘要

本研究以甜瓜种质“新银辉”为试验材料,利用浓度为0.03 g·mL-1的新鲜甜瓜植株水浸提液处理甜瓜幼苗,通过cDNA-AFLP技术分析甜瓜化感自毒作用相关基因及其表达情况.试验中利用82对引物进行扩增,共获得3 600多条差异表达转录衍生片段(TDFs),平均每个引物组合可扩增出30～50条条带,片段大小集中在50～800 bp之间,根据条带强弱和有无的变化,其表达模式可以分为持续表达、瞬时表达、上调表达和下调表达4种情况.选取其中103条TDFs进行回收、测序,共获得75条有效序列,其中上调表达39条,下调表达21条,瞬时表达15条.BLAST结果分析显示其中55条与已知功能基因具有较高的同源性,选取其中10条TDFs,以甜瓜Actin基因为内参照,对其在不同胁迫处理时间的表达情况进行半定量RT-PCR验证,分析结果与cDNA-AFLP结果基本吻合,表明cDNA-AFLP技术是研究甜瓜化感自毒作用相关基因差异表达的有效方法.55条TDFs的BLAST结果显示,甜瓜自毒作用涉及到的基因表达情况较为复杂,与信号转导、能量代谢、蛋白合成、离子运输、逆境响应和转录调控等过程均有关系,这一结果为探讨甜瓜化感自毒作用的分子机理和相关基因的克隆提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈文辉		49	499	12.0	21.0
2	张志忠	福建农林大学园艺学院	49	787	17.0	27.0
3	林文雄	福建农林大学作物学院	321	7047	47.0	70.0
4	孙志浩	福建农林大学园艺学院	5	99	4.0	5.0