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摘要:
基于基因序列的功能性标记是基因分型、图谱定位和相关性状标记辅助选择的理想标记。以'矮生梨'×'茌梨'的梨杂交分离群体和9个梨栽培品种为试材,以梨赤霉素合成代谢途径的关键酶基因--贝壳杉烯氧化酶基因(PpKO)的cDNA序列为基础,设计5对PCR引物,通过高通量熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析,筛选到可对基因进行良好分型的1对引物。通过对杂种后代和测试品种的测序分析表明,此对引物的扩增子是一个位于PpKO第8外显子上的长度为200bp的序列,从中共检测到两处单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)变化,且均为非同义cSNP。这两处SNP标记均可以作为适合高通量分析的遗传标记在遗传作图、基因定位或资源鉴定中加以利用。
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文献信息
篇名 基于梨贝壳杉烯氧化酶基因PpKO序列的功能性SNP标记
来源期刊 园艺学报 学科 农学
关键词 单核苷酸多态性 功能性标记 贝壳杉烯氧化酶基因
年,卷(期) 2012,(10) 所属期刊栏目 果树
研究方向 页码范围 1876-1884
页数 分类号 S661.2
字数 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 田义轲 青岛农业大学园林园艺学院 32 282 9.0 15.0
2 王彩虹 青岛农业大学园林园艺学院 35 285 9.0 15.0
3 李节法 青岛农业大学园林园艺学院 7 86 6.0 7.0
4 殷豪 青岛农业大学园林园艺学院 8 111 6.0 8.0
5 白牡丹 青岛农业大学园林园艺学院 8 53 4.0 7.0
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研究主题发展历程
节点文献
单核苷酸多态性
功能性标记
贝壳杉烯氧化酶基因
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期刊影响力
园艺学报
月刊
0513-353X
11-1924/S
大16开
北京中关村南大街12号
82-471
1962
chi
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