甘蔗丝氨酸/苏氨酸激酶基因的克隆及序列分析

• 作者: 叶冰莹 张积森 陈如凯 陈玲 陈由强 黄贞杰
• 来源期刊: 亚热带农业研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 甘蔗 丝氨酸/苏氨酸激酶 基因克隆 电子克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 194-198
• 页数: 5页
• 分类号: Q946
• 字数: 2320字
• 语种: 中文

摘要

以福农28甘蔗品种为实验材料,电子克隆设计引物,克隆得到了甘蔗丝氨酸/苏氨酸激酶(serine/threonine kinase,STK)基因的cDNA片段.采用RACE技术克隆获得了甘蔗叶STK基因cDNA的5'及3'端序列,长度分别为750和1000bp.5'、3'端序列与中间片段重叠延伸后总片段长为1133 bp,其中5'UTR为54bp,3'UTR为254 bp,包含完整的ORF为825 bp,共编码274个氨基酸.开放阅读框架查询器(Open Reading Frame Finder)确定其为丝氨酸/苏氨酸激酶,通过预测(//cn.expasy.org/tools)该蛋白质分子质量为29.9052 ku,理论等电点为6.36.将其基因序列与NCBI中其他植物的STK进行比对,与高粱、玉米、水稻、短柄草和大麦的相似性分别为97％、94％、89％、89％和88％.