棉花杂交种SSR核心引物的筛选与评价

• 作者: 刘传祥 张献龙 林忠旭 王斌 白静 聂以春 郭小平
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 杂交种 SSR标记 核心引物
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 207-214
• 分类号: S562.035
• 字数: 6053字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-7807.2012.03.003

摘要

为筛选到一套针对棉花杂交种真实性和纯度进行鉴定的核心引物,本实验以79个棉花杂交种为材料,采用分子标记技术,对已公布的2300对SSR引物通过PCR扩增,经初筛和复选,最终获得扩增条带清晰、重复性好且分辨能力强的56对核心引物.利用这56对SSR引物对生产上推广的37个棉花杂交种进行多态性验证,共检测到95个多态性位点,变幅为1～3个；161个基因型,变幅为2～3个.随机抽出10对引物,通过组合方式可以将37个品种完全区分开.对37个品种的SSR分子标记结果进行UPGMA聚类,在相似系数为0.54时,20个长江流域杂交种中有19个被划分到第一类,17个黄河流域品种中有11个被划分到第二类,较好地反映出不同棉区因育种目标的不同所产生的差异.表明该套引物有很好的代表性、实用性和有效性.