应用优化的双向电泳技术建立纤维堆囊菌S00157-2蛋白质组数据库

• 作者: 刘红 吴志红 张鹏翼 徐培培 李越中 熊娟
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 双向电泳 纤维堆囊菌So0157-2 优化 蛋白质组
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 86-94
• 页数: 9页
• 分类号: Q343.1|Q516.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1206.2011.00245

摘要

堆囊菌丰富的次级代谢产物是新药的重要来源,而蛋白质组学分析是研究代谢调控的有效方法.然而堆囊菌含有大量的胞外多糖以及黏液,干扰了蛋白质组学分析中蛋白质的溶解度、分辨率及重现性.为了高通量地筛选Sorangium cellulosum So0157-2表达的特异性蛋白,实验优化了S.cellulosum So0157-2双向电泳方法.首先,S.cellulosum So0157-2蛋白在裂解液中有更好的溶解度.pH 3～10非线性胶条和1 mg的蛋白上样量适用于第一向等电聚焦,分别提高了蛋白质点的分辨率和低丰度蛋白质的表达.15％ SDS-PAGE改善了S.cellulosum So0157-2蛋白分离的分辨率和重现性.最终,通过优化的双向电泳方法获得了S.cellulosum So0157-2在M26培养基中培养3天的全蛋白质表达谱,并检测到552个蛋白质点.进而对表达蛋白通过MALDI-TOF-MS进行质谱鉴定,其中474个蛋白质得到鉴定,鉴定率85.9％.得到鉴定的蛋白质包括细胞结构和功能组分,以及细胞代谢合成酶类,其中8个蛋白质与糖类的转化和代谢相关,这有助于糖基化埃博霉素A的深入研究.该优化方法为进一步建立纤维堆囊菌So0157-2在各种培养条件下的蛋白质组表达数据库打下基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李越中		52	747	16.0	26.0
2	刘红		42	162	7.0	11.0
3	吴志红		10	251	7.0	10.0
4	张鹏翼		1	0	0.0	0.0
5	徐培培		2	6	1.0	2.0
6	熊娟		1	0	0.0	0.0