中国HIV-1 B’亚型毒株不同基因区与全长基因组系统进化比较

• 作者: 何翔 冯毅 李喆 杨尧 邢辉 邵一鸣 魏静
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: HIV-1 B’亚型 pol基因 近全长基因组
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 366-371
• 页数: 6页
• 分类号: R373.9
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在探索不同基因区的使用对HIV-1B'亚型毒株系统进化分析结果的影响.首先利用既往研究中已发表的共计47条来自泰国,缅甸和中国多个地区不同传播途径的B’毒株近全长基因组序列,将其按基因区分为不同的数据集(gag,pol,vif,vpr,vpu,eni,nef),并分别进行系统进化分析研究.比较不同基因区系统进化分析的结果发现.B’亚型毒株pol基因在分析的基因区中,具有最低的复杂度和进化速率,可以较好的区分B'TH和B’YN毒株,重复近全长基因组序列的分析结果；尽管env基因则具有最高的复杂度和进化速率,但无法获得类似结果.本研究比较了不同基因区对HIV-1 B’亚型毒株系统进化分析结果的影响,对进一步开展HIV分子流行病学调查,分析我国B'毒株在我国的传播奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邢辉		75	447	11.0	17.0
2	邵一鸣		140	694	14.0	20.0
3	何翔		7	26	4.0	5.0
4	李喆		1	0	0.0	0.0
5	杨尧		1	0	0.0	0.0
6	魏静		1	0	0.0	0.0
7	冯毅		5	10	1.0	3.0