芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较

• 作者: 刘国红 刘波 林乃铨 林营志
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 芽胞杆菌 脂肪酸类型 ITS序列 分类
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 173-180
• 分类号: S476
• 字数: 5740字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0384.2012.02.013

摘要

基于ITS序列和脂肪酸鉴定方法对从土壤中分离得到的16株芽胞杆菌进行分类研究,与分子鉴定结果相比,脂肪酸种的鉴定准确率可达到99％以上.通过生物软件SPSS和Mega分别对16株菌进行聚类分析,结果表明,脂肪酸比ITS更适合于芽胞杆菌的分类研究,根据脂肪酸成分可以将16株芽胞杆菌准确聚在一起,而ITS则不能.芽胞杆菌特征性脂肪酸为15∶0ANTEISO和15∶0ISO,但不同种芽胞杆菌的此类脂肪酸含量不同.对芽胞杆菌3大类菌群主要特征性脂肪酸的含量比例(15∶0ISO/15∶0ANTEISO)进行了分析,其中比较特殊的为蜡状芽胞杆菌类群,蜡状芽胞杆菌主要脂肪酸为15∶0ISO,其次为13∶0ISO,而15∶0ANTEISO的含量很低,而且不是主要类型,15∶0ISO/15∶0ANTEISO的比值约为5.6～7.9.简单芽胞杆菌群主要脂肪酸为15∶0ANTEISO和15∶0ISO,15∶0ISO/15∶0ANTEISO比值约为1/6.巨大芽胞杆菌类群主要脂肪酸15∶0ISO和15:0ANTEISO含量相近,其余脂肪酸远远低于这2种主要脂肪酸.巨大芽胞杆菌的15∶0ISO/15∶0ANTEISO的比值约为4/5～5/4,菌株FJAT-4500为短小芽胞杆菌,其15∶0ISO/15∶0 ANTEISO比值约为2.短小芽胞杆菌和巨大芽胞杆菌归为一类是因为其脂肪酸类型相近,但含量并不同.枯草芽胞杆菌群主要脂肪酸15∶0ISO的含量小于15∶0ANTEISO,15∶0ISO/15∶0ANTEISO的比值为1/3～2/3.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘波		496	4446	29.0	44.0
2	林乃铨		72	802	15.0	25.0
3	林营志		54	629	12.0	23.0
4	刘国红		12	103	6.0	10.0