X病毒属6个成员中国分离物CP基因的克隆及同源性分析

• 作者: 华俊雅 杨宇 隗洋洋 韦传宝
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 农学
• 关键词: 葱属X病毒属 CP基因 基因克隆 同源性分析 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 页码范围: 79-82
• 分类号: Q785|S436.421
• 字数: 2517字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2012.02.03

摘要

根据Genbank报道的大蒜A病毒(GarVA)、大蒜B病毒(GarVB)、大蒜C病毒(GarVC)、大蒜D病毒(GarVD)、大蒜E病毒(GarVE)和大蒜X病毒(GarVX)的序列设计引物,克隆外壳蛋白(CP)基因、测序并进行同源性分析.结果表明,6种病毒CP基因分别由756、735、780、753、759和732核苷酸组成.氨基酸序列多重对齐比对结果表明,GarVC与GarVD同源性最低(57.69％),GarVB与GarVX同源性最高(87.70％)；同属6种病毒CP基因在C端变异性大,N端保守.进化树显示GarVA、GarVE和GarVD成簇,GarVB和GarVX成簇,GarVC与其他5种病毒亲缘关系较远.本研究结果为预测6种病毒之间是否存在血清学交叉反应,在进行ELISA检测是否会相互干扰提供指导意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韦传宝	皖西学院生物与制药工程学院	78	287	9.0	12.0
3	杨宇	皖西学院生物与制药工程学院	6	17	3.0	3.0
6	华俊雅	皖西学院生物与制药工程学院	4	8	2.0	2.0
7	隗洋洋	皖西学院生物与制药工程学院	3	6	2.0	2.0