梅花鹿GHR基因完整编码区序列生物信息学分析

• 作者: 宋兴超 巴恒星 杨福合 邢秀梅 魏海军
• 来源期刊: 特产研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 梅花鹿 生长激素受体基因 编码区 生物信息学分析 系统进化
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-5,19
• 页数: 6页
• 分类号: Q754
• 字数: 3550字
• 语种: 中文

摘要

为了研究梅花鹿生长激素受体基因的结构和功能,从GenBank中下载梅花鹿、牛、山羊、猪、北极狐、大熊猫、人、猕猴、小鼠、大鼠、鸡、家鹅、绿头野鸭及金鱼的生长激素受体基因完整编码区及氨基酸序列,对梅花鹿与其他13个物种生长激素受体基因的完整编码区及其编码氨基酸序列进行相似性比对,并基于氨基酸序列构建系统进化树,利用BioEdit 7.0等软件对梅花鹿生长激素受体基因的碱基组成及其编码蛋白的理化性质和结构特征进行生物信息学分析.结果表明,梅花鹿与山羊、牛的生长激素受体基因氨基酸序列相似性较高,亲缘关系最近;梅花鹿生长激素受体基因完整编码区长度为1 905bp,编码634个氨基酸,A+T含量高于G+C;其编码的蛋白是一种分子质量为70.927 8ku、等电点为4.56的疏水性不稳定酸性蛋白;该蛋白含有1个信号肽,属于一种分泌型蛋白;存在1个强跨膜区、36个广泛磷酸化位点,二级结构元件以无规则卷曲为主.研究结果可为梅花鹿生长激素受体基因的进一步分析提供详细的生物信息学基础资料.