白菜型油菜和菜薹的InDel标记开发及其RILs群体遗传连锁图谱的构建

• 作者: 刘博 孟霖 林良斌 武剑 王晓武 程峰
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 菜薹 油菜 白菜 插入/缺失 全基因组重测序 Illumina测序 遗传连锁图
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 所属期刊栏目: 蔬菜
• 页码范围: 1491-1500
• 分类号: S634
• 语种: 中文

摘要

通过白菜型油菜‘R—O-18’和菜薹‘L58’的基因组重测序数据与白菜基因组的参考序列（‘Chiifu-401·42’的基因组序列）的比对，在全基因组范围内检测到了18479个短插入缺失变异位点（≤5bp）。从中挑选了500个插入／缺失片段为4～5bp的InDel变异位点，将其设计成InDel分子标记并进行试验验证，结果有452个标记通过PCR扩增出单一条带，但仅有106个在‘R．O-18’和‘L58’间表现出多态性，346个没有多态性，48个在PCR中没有扩增。亲本间具有多态性的106个InDel标记可用来检测以‘R—O-18’和‘L58’为亲本构建的RILs基因型，并构建了一张包含99个标记的遗传连锁图谱。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林良斌	云南农业大学农学与生物技术学院	58	692	15.0	24.0
2	王晓武	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	100	1954	26.0	39.0
3	武剑	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	30	267	10.0	14.0
4	刘博	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	34	303	10.0	16.0
5	程峰	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	3	24	1.0	3.0