陆地棉苗期低温胁迫下cDNA-AFLP差异表达分析

• 作者: 卫珺 李廷春 林毅 樊洪泓 王旺华 蔡永萍
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 低温胁迫 cDNA-AFLP 基因差异表达 转录衍生片段
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 386-392
• 页数: 7页
• 分类号: S562.035.3
• 字数: 4256字
• 语种: 中文

摘要

以陆地棉品系棕彩选1号为材料,利用cDNA-AFLP技术研究棉花低温处理前后基因表达的差异.试验采用64对引物组合进行扩增,共获得2321个条带,从中得到34条表达存在差异的条带.根据表达模式的不同,对其中表达存在差异的22个转录衍生片段(Transcripts derived fragments,TDFs)进行了克隆、测序和序列分析.结果表明:在低温胁迫条件下获得的18条TDFs中,上调表达2条(11％),下调表达9条(50％),另外7条(39％)为瞬时表达；而在恢复2d后得到了4条特异表达的TDFs.22个TDFs中,21个TDFs与NCBI中已知功能基因存在同源性,这些基因包括假定蛋白、转座子、线粒体、过氧化物酶体增殖物激活受体和逆境胁迫反应关键基因等.另有1个TDFs无同源序列.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡永萍	安徽农业大学生命科学学院	167	2775	29.0	45.0
2	林毅	安徽农业大学生命科学学院	139	2078	27.0	38.0
3	李廷春	安徽农业大学生命科学学院	15	221	8.0	14.0
5	樊洪泓	安徽农业大学生命科学学院	42	540	13.0	22.0
8	卫珺	安徽农业大学生命科学学院	1	2	1.0	1.0
9	王旺华	安徽农业大学生命科学学院	1	2	1.0	1.0