建鲤IGFBP1基因的克隆及与增重相关的SNP位点分析

• 作者: 俞菊华 唐永凯 夏正龙 李建林 李红霞 魏可鹏
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 建鲤 IGFBP1 SNP 增重 相关性
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 页码范围: 75-80
• 分类号: Q953|Q78
• 字数: 4085字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7091.2012.03.015

摘要

旨为查找建鲤(Cyprinus carpio var.jian,)胰岛素样生长因子结合蛋白1(Insulin-like growth factor binding proteins 1,IGFBP1)基因上与增重相关的SNP位点.利用基因克隆,Clustal W比较8个个体的DNA序列,筛选SNP位点.并采用PCR-RFLP方法检测了其中2个位点(1b-E1-A210G,1b-E3-C108T)在913尾建鲤((♂) 469,♀444)中的基因型分布.成功分离得到了建鲤IGFBP1的2条DNA序列,并在1a、1b上分别找到7个和24个SNPs位点,其中,1a外显子上有2个,1b外显子上有4个.检测的2个位点与增重的相关性分析表明:2位点均与雄鱼增重呈极显著相关(P＜0.01),其中,增重快的基因型在鱼种阶段分别为GG型和CC型,在成鱼阶段分别为AG型和CC型.与雌鱼鱼种阶段增重相关的位点为A210G,其AG型增重极显著快于AA型(P＜0.O1),与雌鱼成鱼阶段增重相关的位点为C108T,其CC型、CT型增重极显著快于TT型(P＜0.01).对组合成的9种双倍型与增重的相关性分析表明:雌雄鱼中双倍型D4、D5、D7个体生长显著(P＜0.05)或极显著(P＜0.01)快于双倍型D6、D9个体,D4、D5、D7双倍型个体在整个样品中占60％,还存在改良空间.试验检测的2个位点A210G、C108T可作为建鲤增重相关的分子标记应用于育种实践.