草鱼醛缩酶B基因部分序列的SNP多态性及其与生长性状的关联分析

• 作者: 于凌云 曹婷婷 樊佳佳 白俊杰
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 草鱼 醛缩酶B 基因型 双倍型 生长关联分析
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 页码范围: 481-488
• 分类号: Q343.1+5|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2012.27626

摘要

通过佛山市白金水产良种选育场提供的草鱼EST库的醛缩酶B基因重叠群的2个Contig扩增该基因的序列片段,采用直接测序法,经过序列比对,共筛到C+687G、C+1042A和A117C等3个颠换SNPs位点.C+687G位于醛缩酶B基因外显子6的63bp处,为同义突变；C+1042A位于外显子8的43 bp处,为错义突变；A117C位于内含子7的117bp处.采用Snapshot方法对同一群体的296尾草鱼的这3个SNPs位点进行检测和分型,并统计基因型频率.3个SNPs位点中AA的频率分别为42.9％、32.8％、32.8％; AB的频率分别为42.9％、45.9％、45.6％; BB的频率分别为14.2％、21.3％、21.6％.利用一般线性模型分析3个SNPs位点与草鱼体质量、体长等重要生长性状的关系,关联分析结果显示,C+687G位点不同基因型只在体长/尾柄长比值上存在显著差异(P＜0.05),和体质量等重要生长性状不相关.A117C和C+1042A两个位点都在体质量等4个生长性状上存在显著差异(P＜0.05).将3个SNPs位点不同基因型两两位点组成3个组合的双倍型(都去掉了频率小于3％的组合),结果显示,C+687G和A117C以及C+687G和C+1042A的2个组合分别组成的7种双倍型在体质量等5个生长性状上都存在显著差异(P＜0.05); A117C和C+1042A组成的3种双倍型在体质量、眼间距等2个生长性状上都存在显著差异(P＜.05).研究认为,可以考虑将草鱼醛缩酶B基因作为生长相关的候选基因,用于草鱼的分子辅助育种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	白俊杰	中国水产科学研究院珠江水产研究所中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室	104	1312	20.0	28.0
3	于凌云	中国水产科学研究院珠江水产研究所中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室	9	94	7.0	9.0
6	曹婷婷	中国水产科学研究院珠江水产研究所中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室	2	39	2.0	2.0