粤东海域褐菖鲉种群线粒体DNA控制区序列变异及其在平鲉亚科中的分类地位

• 作者: 周发林 张殿昌 朱彩艳 杨丽诗 江世贵 苏天凤 黄建华
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 褐菖鲉 线粒体DNA 遗传变异 分子系统
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1-8
• 分类号: S917
• 字数: 4426字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7075.2012.02.001

摘要

对捕自粤东海域的47尾野生褐菖鲉Sebastiscus marmoratus线粒体DNA控制区序列进行了扩增和序列变异分析,并结合GenBank中10种其他平鲉亚科的同源序列,分析了平鲉亚科的分子系统.结果表明,所获序列长度在538～544 bp之间,具69个碱基替换位点和36个插入/缺失位点；控制区碱基组成中,A、T、C、G含量分别为34.5％、29.0％、15.8％、20.7％.共检测到38个单倍型.该种群的单倍型多样度(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.978和0.019 2.以鲉亚科棘鲉Hoplosebastes armatus作为外群构建的分子系统树显示,褐菖鲉为11种平鲉亚科中较早分化出的种,位于进化树的基部；平鲉亚科为单系群,分为4个分支,分别为平鲉属Sebastes、菖鲉属Sebastiscus、眶棘鲉属Hozukius和无鳔鲉属Helicolenus,与传统的分类地位一致.研究结果表明,控制区序列不仅适合褐菖鲉种群遗传多样性研究,同样也适合分子系统发育研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张殿昌	中国水产科学研究院南海水产研究所	35	385	13.0	18.0
2	朱彩艳	中国水产科学研究院南海水产研究所	20	194	9.0	13.0
3	苏天凤	中国水产科学研究院南海水产研究所	58	1015	17.0	29.0
4	江世贵	中国水产科学研究院南海水产研究所	100	1501	22.0	31.0
5	周发林	中国水产科学研究院南海水产研究所	46	696	17.0	24.0
6	黄建华	中国水产科学研究院南海水产研究所	49	612	17.0	22.0
7	杨丽诗	中国水产科学研究院南海水产研究所	8	84	4.0	8.0