仿刺参微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析

• 作者: 廖梅杰 张正 李彬 潘传燕 王印庚 臧云鹏 荣小军 陈贵平
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 刺参 微卫星标记 FIASCO 遗传多样性 遗传结构
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 72-82
• 分类号: Q959.26
• 字数: 5915字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7075.2012.04.010

摘要

采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing Repeats)方法构建了仿刺参基因组富集CA微卫星序列的基因组短片段文库,筛选得到118条微卫星DNA序列.根据重复单元的排列特点,完美型共83个,占70.4％；非完美型共30个；占25.4％；复合型标记5个,占4.2％.选取其中20条微卫星序列设计引物进行多态性检测,并利用这20对引物对采自中国、韩国(西海岸及东海岸)、俄罗斯和日本沿海的野生仿刺参以及美国沿海的具疣拟刺参进行遗传多样性水平和遗传结构分析.结果表明,所设计的20对引物的扩增产物均具有多态性,其中16个位点为高度多态(PIC＞0.5).遗传多样性分析结果显示,20个微卫星座位的平均观察杂合度(Ho)和平均期望杂合度(He)分别为0.39和0.69,共检测到231个等位基因(102个有效等位基因),在每个座位上获得3～20个等位基因,平均等位基因数为11.6个,20个位点在6个群体中不同程度偏离遗传平衡(P＜0.05),所有群体在整体上均表现为杂合子缺失(Fis＞0)；5个仿刺参群体间的遗传相似系数在0.71以上,相似性较高,而仿刺参群体与具疣拟刺参的相似性则较低.聚类分析结果表明,中国群体与韩国西海岸群体聚类成一支,而俄罗斯群体、韩国东海岸群体和日本群体聚类成另外一支,聚类的先后与它们在地理分布上的海域位置有一定的相关性.