半滑舌鳎IRF-7基因的全长cDNA克隆及表达分析

• 作者: 刘万建 史成银 宋展 李赟 耿伟光 黄倢
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 半滑舌鳎 干扰素调节因子7 Poly Ⅰ:C 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 39-47
• 分类号: S917.4
• 字数: 5513字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7075.2012.05.006

摘要

本研究克隆了半滑舌鳎干扰素调节因子7(CsIRF-7)cDNA的全长序列,并对该基因进行了结构特征分析,同时还完成了该基因在半滑舌鳎各组织中表达水平的定量分析.结果表明,CsIRF-7基因cDNA全长为1 957 bp,其中包含48 bp的5'-UTR、1 302 bp的ORF和607 bp的3'-UTR.CsIRF-7 cDNA编码一个由433个氨基酸残基组成的多肽.氨基酸序列比对结果表明,CsIRF-7多肽与脊椎动物IRF-7相似,存在高度保守的3个结构域:DNA结合域(DNA binding domain,DBD)、干扰素相关区(IRF associated domain,IAD)和丝氨酸富含区(Serine-rich domain,SRD).全长氨基酸序列同源性分析发现,CsIRF-7与硬骨鱼类的IRF-7同源性较高,与4种硬骨鱼类的同一性和相似性分别介于48.5％～73.6％和65.4％～83.8％之间；其中与牙鲆的同一性和相似性最高,分别为73.6％和83.8％；而与哺乳类和鸟类IRF-7的同源性较低,其同一性和相似性分别仅为30.3％～32.2％和46.5％～52.5％.系统进化分析表明,CsIRF-7与硬骨鱼类的IRF-7聚为一类,并与其他脊稚动物的IRF-7和IRF-3共同组成了脊椎动物IRF-3亚家族.实时荧光定量PCR检测结果显示,CsIRF-7基因在半滑舌鳎的肝、肾、脾、血细胞、鳃、肠和心脏等7种检测的组织中均有表达,在肠中表达量最高,而在肝、鳃和血细胞中表达量相对较少.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李赟	中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室	48	532	14.0	20.0
2	史成银	农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所	10	52	4.0	7.0
3	刘万建	中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室	1	3	1.0	1.0
7	宋展		1	3	1.0	1.0
8	耿伟光	农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所	1	3	1.0	1.0