绒山羊RORα基因2种亚型的结构与进化分析

• 作者: 刘永志 吴江鸿 孙海莲 张文广
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 绒山羊 RORα基因 RACE 编码蛋白 进化
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 页码范围: 110-117
• 分类号: S826.91
• 语种: 中文

摘要

为深入研究绒山羊RORα基因的结构及功能,利用cDNA末端快速扩增法（RACE）结合转录组获得了绒山羊（Capra hircus）维甲酸相关孤核受体（retinoic acid receptor-related orphan receptorα,RORα）基因的2个亚型：RORα1和RORα2（GenBank登录号分别是HM_061155和HM_358053）。序列分析表明,RORα1序列全长1 620bp,包括5′端非翻译区（untranslated region,UTR）29bp、3′端非翻译区211bp和开放阅读框（open reading frame,ORF）1 380bp,共编码459个氨基酸,分子质量约为52.3ku,理论等电点6.25。RORα2序列全长1 694bp,包括5′UTR 76bp、3′UTR 211bp和ORF 1 407bp,共编码468个氨基酸;与人RORα4的长度相同,相似性达99%,分子质量约为53.4ku,理论等电点为6.37。结果显示：1）RORα1氨基酸序列缺少大多数核受体具有的调节区（A/B区）,预测的二级结构少一个β-折叠基序（YFV）;2）RORα的DNA结合区到配体结合区部分属于纯化选择,A/B区在长度和序列方面变异都很大。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张文广		4	23	2.0	4.0