烟草NtRAX基因的克隆和序列分析

• 作者: 刘贯山 孙玉合 崔萌萌 张泽坤 李凤霞 王卫锋 高晓明
• 来源期刊: 中国烟草科学
• 关键词: 烟草 腋芽 基因 NtRAX
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 页码范围: 14-18
• 分类号: S572.01
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5119.2012.05.003

摘要

根据GenBank中拟南芥RAX基因序列,在烟草EST数据库中进行Blastp检索,获得与之同源性较高的蛋白质序列,选取同源性最高的蛋白质序列所对应的核酸序列,设计引物,获得中间片段,再运用中间片段设计引物,应用 RACE 方法获得其5′和3′末端cDNA序列,将获得的3段序列拼接,结合全长克隆测序验证,获得一个新的普通烟草基因,将其命名为NtRAX(NCBI登录号为JQ228591).NtRAX的cDNA全长为1112 bp,5′端非编码区96 bp,3′端非编码区62 bp,编码区长度为954 bp,编码317个氨基酸,预测的分子量是35.42 KDa.对该基因进行序列分析和功能预测,得出该基因属于MYB基因家族,是具有转录激活活性的烟草腋芽分生组织形成的调控基因.