四种de novo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组组装结果的比较

• 作者: 刘宗林 周泽扬 许金山
• 来源期刊: 蚕学通讯
• 学科: 农学
• 关键词: 微粒子病 柞蚕微孢子虫 de novo组装 基因组
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 1-5
• 分类号: S885.1
• 字数: 1670字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-0561.2012.03.001

摘要

柞蚕是一类以柞树叶为食料的经济类吐丝结茧昆虫,柞蚕微孢子是寄生在柞蚕体内的一种微孢子虫,是柞蚕微粒子病的病原,其主要通过食下传染或者母体传染来感染柞蚕.目前在分子水平上对柞蚕微孢子虫的研究还很少,本研究通过比较分析四种常见的de novo组装软件对柞蚕微孢子虫全基因组的组装,结果显示不同的软件组装的结果相差甚远,由此表明由于柞蚕基因组本身结构的特殊性及组装软件的针对性,导致了组装质量的差异性.本研究对于今后昆虫微孢子虫基因组的组装软件的选择优化提供了重要的参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周泽扬	重庆师范大学重庆市动物生物学重点实验室	59	388	9.0	17.0
10	刘宗林	重庆师范大学重庆市动物生物学重点实验室	1	5	1.0	1.0
14	许金山	重庆师范大学重庆市动物生物学重点实验室	16	33	4.0	4.0