闽江口芦苇沼泽湿地土壤产甲烷菌群落结构的垂直分布

• 作者: 仝川 佘晨兴
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 产甲烷菌 群落结构 垂直分布 PCR-RFLP 芦苇湿地
• 年，卷（期）: 2012,（17）
• 页码范围: 5299-5308
• 分类号: X172
• 语种: 中文
• DOI: 10.5846/stxb201203050299

摘要

应用PCR-RFLP技术及测序分析对闽江口芦苇湿地土壤产甲烷菌群落结构的垂直分布特征进行了研究.在构建的6个克隆文库中,每个克隆文库随机挑选100个克隆进行菌落PCR验证,共得到591个阳性克隆.PCR产物经限制性内切酶MspⅠ进行RFLP分析后得到37个不同的分类操作单元(OTUs).对37个克隆子进行了序列测定,与GenBank数据库中的序列进行比对,最近相似性在91％-99％之间.RFLP分析和系统发育分析表明,闽江口芦苇湿地土壤中产甲烷菌群落包括3大类群:甲烷杆菌目(Methanobacteriales)、甲烷微菌目(Methanomirobiales)和甲烷八叠球菌目(Methanosarcinales).不同土壤深度中产甲烷菌群落的分布呈现出不同的特征.土壤表层(0-10 cm)优势产甲烷菌类群为Methanoregula,约占76％；10-20 cm土层主要的产甲烷菌类群为Methanolinea和Methanoregula,分别约占23％和29％；20-30cm土层优势的产甲烷菌类群为Methanolinea,约占66％.Shannon指数(H')和Simpson多样性指教(D)表明,10-20cm土层产甲烷菌多样性高于土壤表层(0-10cm)和20-30 cm土层.37个测序OTUs中有26个OTUs属于不可培养的产甲烷菌序列,表明闽江口芦苇湿地土壤中存在大量不可培养的产甲烷菌.