汉坦病毒M、S基因分型及种系进化分析

• 作者: 刘佳惠 刘富强 刘运芝 张红 曾舸 李俊华 胡世雄 蔡亮 高立冬
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肾综合征出血热 汉坦病毒 M基因 S基因 分型 种系进化
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 111-115
• 分类号: R373
• 字数: 3394字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2012.02.004

摘要

目的 探讨湖南省肾综合征出血热(HFRS)患者及宿主动物黑线姬鼠携带汉坦病毒的基因型别及序列特征.方法 应用免疫荧光试验(IFA)对鼠肺标本进行粗筛,提取IFA阳性鼠肺组织及HFRS患者血清总RNA,设计汉坦病毒M、S基因特异性引物,应用RT-PCR技术进行扩增,回收阳性扩增产物并克隆到pMD-18T载体进行序列测定,将所测序列与国内外HTNV及SEOV病毒株序列进行核苷酸同源性分析,应用MEGA5.0.4软件构建M、S基因种系进化树,结果 IFA阳性鼠肺标本荧光显微镜下可见做在的黄绿色针尖大小样颗粒;RT-PCR法扩增汉坦病毒M、S基因,HTNV通用引物可见490bp与593 bp的阳性条带;阳性产物进一步应用HTNV分型引物进行M、S基因检测,分别扩增出-约242 bp与276 bp大小的条带;SEO型特异性M、S基因片段内侧引物扩增反应均为阴性;编号为Hunan01、Hunan02、Hunan03的M、S基因序列与HTNV型84FLi株、SN7株的同源性最高,与SEOV型Gou3株的同源性最低;种系进化分析表明,Hunan01、Hunan02、Hu-nan03为汉坦病毒H5亚型.结论湖南省存在HTNV型感染病例与宿主动物,基因分型技术能进一步对病毒亚型进行鉴定.