用于区别不同棉花品种基因组特征的微卫星位点筛选

• 作者: 梅鸿献 蔡彩平 赵亮 郭旺珍*
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 棉花 品种 微卫星位点 DNA条形码
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 页码范围: 1810-1817
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2012.01810

摘要

保守性强、重复性好、多态性高的微卫星位点可被有效用于构建作物DNA条形码.选取目前生产上主要推广种植、代表不同来源系统的12个棉花品种作为微卫星位点筛选材料,参考已构建的四倍体栽培棉种种间高密度遗传图谱信息,从376对覆盖全基因组的SSR引物中,筛选出51对引物可扩增出带型清晰且多态性高的微卫星位点.这些引物在12个供试品种中共产生155个等位位点,每对引物揭示的等位基因位点在2~7之间,平均值为3.04.参照微卫星位点的染色体定位和多态信息,在每条染色体上选择一个多态性相对高的 SSR 位点,其相应的26对 SSR引物被推荐为构建棉花品种DNA条形码的一套首选引物,并初步应用于12个品种的DNA条形码编制.其余25对引物作为候选引物.使用该套引物扩增出的微卫星位点可用于大量棉花品种DNA条形码构建,为棉花品种真实性和纯度的分子鉴定奠定基础.