蓖麻基因组中一种Mutator-like类型MITEs元件的结构分析和鉴定

• 作者: 卢诚 周新成 李正绪 王文泉 王海燕 胡梅珍
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: MITEs Mutator-like 蓖麻 转座子
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术应用
• 页码范围: 327-331
• 分类号: Q78
• 字数: 3468字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2012.02.022

摘要

利用生物信息学方法,对蓖麻基因组Mutator-1ike类型MITEs元件进行了分析和鉴定.结果表明,蓖麻基因组上共鉴定出76个小于3 kb的Mutator-like类型MITEs元件,其中长度小于1 000bp的元件有53个,占69.7％.这些MITEs元件中有42个位于基因间隔区,11个位于基因内含子区,位于5'UTR和3'UTR区的分别有8个和4个,另有1个位于基因编码区.29个MITEs元件带有转座酶以外的功能基因片段,成为pack MITEs.多个pack-MITEs带有相同的非转座酶基因片段.Mutator-like类型的MITEs对蓖麻基因的表达和基因组的进化有潜在的影响,值得深入分析.